Идея создания энциклопедии, специально посвященной эпистемологии и философии науки, долго созревала в коллективе Института философии Российской Академии наук. Ее реализация началась в 2003 при активной поддержке руководства Института и с участием целого ряда известных специалистов из других философских учреждений России. С самого начала было решено ограничить круг авторов теми философами, для которых русский язык является родным, и тем самым показать современный уровень отечественных исследований в данной области.